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    2000年6月建立研究生院。　　南京农业大学起源于1902年三江师范学堂农业博物科，前身是私立金陵大学农学院和国立中央大学农学院。1963年被确定为全国两所重点农业高校之一。1972年搬迁至扬州，与当时的苏北农学院合并成立江苏农学院，1979年搬回南京，恢复为南京农学院。2007年4月再次以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估；学校还设有“国家大学生文化素质教育基地”、“国家理科基础科学研究与教学人才培养基地”和“国家生命科学与技术人才培养基地”。1999年4月首批通过全国高校本科教学工作优秀评价。1952年院系调整时，上述两院以及浙江大学农学院部分系科合并，成立南京农学院。1984年经教育部批准更名为南京农业大学。

  近年来，SCI收录论文快速增长，2007年SCI收录及引用篇次在全国高校排名均进入前50名行列，CSTPCD（学术榜）收录论文1643篇，连续两年跃居农林类高校第二。　　——科学研究  现有14个（含1个培育点）国家级重点学科，23个省（部）级重点学科。获国家、部省级科技成果奖100余项，其中国家级奖7项。李显春博士的一篇论文2002年10月在《Nature》上发表，是我国农业高校在《Nature》上发表的第二篇论文。建有“作物遗传与种质创新”国家重点实验室、国家肉品质量安全控制工程技术研究中心和国家大豆改良中心，40多个省部级重点开放实验室、工程技术中心和研究所。“十五”以来，国家自然科学基金、科技部、教育部、农业部等各级、各类项目立项2000余项，获资助经费10亿多元，纵向到位科研经费以年均20%的速度递增，年度获国家自然科学基金项目经费超过2000万元，在全国高校中位居前列。《南京农业大学学报》（自然版）2008年度影响因子上升至0。。693，连续六年获得“中国百种杰出学术期刊”称号，并入选“2008年度中国精品科技期刊”。学校充分发挥自身学科及人才优势，主动为社会发展服务、为“三农”服务，创造了巨大的经济效益和社会效益，多次被评为国家和江苏省科教兴农、科技扶贫工作先进单位。《南京农业大学学报》（社科版）2007年度影响因子上升至0。。514，入选“省直重点社科理论期刊”，并入选CSSCI（中文社会科学引文索引）的来源期刊。

  　　——学科专业设置  现有13个博士后流动站、12个博士学位一级学科授权点、17个硕士学位一级学科授权点，65个博士学科专业、106个硕士学科专业、59个本科专业（其中国家和省级品牌特色专业17个），以及兽医博士和兽医硕士、农业推广硕士、工程硕士、公共管理硕士（MPA）、风景园林硕士等六种专业学位授予权，形成了博士、硕士、学士以及包括成人教育与干部培训在内的完整的人才培养体系。

  在长期的办学历程中，学校先后培养和造就了48位两院院士。近年来，有6篇博士学位论文被评为全国百篇优秀博士论文。　　——人才培养  目前，全校各类在校生共有30000余人，其中全日制本科生16000余人，研究生7000人。

  　　——精神文明建设  近几年来，先后通过了江苏省党建工作优秀评估和校风建设优秀单位评估，先后荣获“江苏省党建和思想政治工作先进单位”、“江苏省文明学校”、“江苏省文明单位”、“江苏省高校先进基层党组织”、“全国精神文明建设工作先进单位”、“全国文明单位”等称号。

  　　——师资队伍  现有在职教职工2683人，其中：中国工程院院士2名，博士生导师268人，硕士生导师573人，国家、部级有突出贡献中青年专家37人，“长江学者奖励计划”特聘教授2人，获“国家杰出青年科学基金”9人，国家教学名师1人，入选国家“百千万人才工程”第一、二层次专家8人，入选教育部“跨世纪优秀人才培养计划”8人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者27人，教育部“优秀青年教师资助计划”18人。

  　　——学校建设目标  学校的发展定位是：以农业和生命科学为优势和特色，农、理、经、管、工、文、法多学科协调发展、国内一流、国际知名的高水平研究型大学。在教学质量、学科建设、科学研究、管理水平和办学效益等方面都得到明显提高，整体实力达到我国高等教育的先进水平，主要办学指标居于我国同类高校的前列，主干重点学科接近和达到国际先进水平，成为以农业与生命科学为特色的知识创新与扩散基地，高层次创新、创业型人才的培养基地和区域性国际合作与学术交流中心。

  南京农业大学是一所直属教育部领导的，以农业和生命科学为优势和特色，农学、理学、经济学、管理学、工学、文学、法学多学科协调发展的全国重点大学，是国家“211工程”重点建设的大学之一。现任党委书记管恒禄教授，校长郑小波教授。

  　　——教学机构  全校现有生命科学学院、农学院、植物保护学院、资源与环境科学学院、园艺学院、动物科学技术学院（含渔业学院）、经济管理学院、动物医学院、食品科学技术学院、信息科学技术学院、公共管理学院（含土地管理学院）、外国语学院、人文社会科学学院、理学院、工学院（含乡镇企业学院）、国际教育学院等16个学院和体育工作部。另设有金陵研究院、成人教育学院、中华农业文明研究院、中央农业干部教育培训中心南农大分院等机构。

  近年来，学校不断探索多形式、多层次的国际合作模式，先后与美国农业部Clay研究中心建立“中美食品安全与质量联合研究中心”、与荷兰格罗宁根大学建立“中荷地籍发展和规划中心”、与日本东京大学建立“中日植物分子生态学联合实验室”等联合研究机构。　　——国际交流与合作  校国际交流与合作十分活跃，先后与20多个国家和地区的100多所高校、研究机构建立了学术交流和科研合作关系。坚持“多渠道招生、多元化投入、多层次培养”的留学生教育发展模式，留学生规模不断扩大，被教育部确定为“接受中国政府奖学金来华留学生院校”，2008年被教育部列为全国首批“教育援外基地”。